20XX年、とある軍事企業が開発した“超大量破壊兵器“がテロ組織に奪われたことから、日本は最終戦争の危機を迎える。そんな中、殺人兵器に改造されたサイボーグの早乙女クリスは、サラという謎の少女と出会う。しかし、彼女こそが超大量破壊兵器だった。