有一天，小光正在观察星空时突然被一道虫洞瞬间转移到了奇迹手电筒工场所在的行星，在那里她发现宇宙的光芒正在逐渐消失，星星也开始慢慢被黑暗所包围。意识到这即将是黑暗笼罩世界的前兆的小光与她所在的星光闪亮☆光之美少女将会与HUG! 光之美少女以及光之美少女：食尚甜心的成员一起，即将展开一场夺回全宇宙光辉的

故事發生在被選召的孩子們首次接觸數碼世界的6年後。2005年的一天，東京港區海面上的波浪在朝陽下搖曳……17歲的高中生八神太一，如常地用手按停眼前的鬧鐘，踢開混亂的被鋪，低聲滴咕下伸展四肢。拉開了窗簾，光線照到桌上一幅「那一天」的集體照上。隨後他在「一路順風，哥哥」的送別聲下，騎上腳踏車出門，奔向那