天启皇帝驾崩，崇祯即位之时，准备法办奸臣魏忠贤一党，在这关键时刻却发现记载魏罪证的万言书被盗，六扇门和魏忠贤的党羽银鬼同时出发追踪盗书之人，并展开了关乎正邪交锋、恩怨情仇甚至社稷安慰的最终“绝战”！

大金使节达哈苏出使大明以求两国平和，六扇门接到使命护卫。却不料达哈苏抵达后，其副手俄然发问，里应外合占据了六扇门，目的是要杀死达哈苏，挑起两国战役。面临沦亡，同门惨遭屠杀，玄武小组打开拼死的激战。

高丽叛军突起，大明援其火器并由高丽将军崔代元押送，不料途中被劫，六扇门玄武小组调查发现是监守自盗盖因崔之义女被叛军绑架，陷崔于两难境地。玄武小组为崔打动，誓在追回火器的同时救出人质，保其忠义两全！

专门关押监犯的黑山监狱年久失修，欲将监犯搬运，六扇门接到任务帮忙。张一带着唐珂前往预备，不料监狱中临时关押的两个女犯却引来了一批奥秘杀手血洗铁牢，张一和唐珂无可奈何联合狱中监犯一起抗敌，等待救援……

圣约翰大学实验室女教授于胜男（李若斯 饰）和科学家康华生（徐亮 饰）结伴来至梧县，调查总探长洪涛的老友——狱警老苏州苏义——公报私仇杀害某黑帮头目的案子。案情扑朔迷离，老苏州也供认不讳，但胜男、华生二人通过缜密的调查还是发现该案的蹊跷之处。他们合力拆穿了作为目击证人刘小三的虚假证词，而刘小三为避免被

上海法租界连发三起命案，三个看似完全没有任何关系的死者竟然都有着同一个名字“钟鸣”。凶手擅长使用剧毒暗器和反关节格斗，心理素质极其之高，很可能是一个身怀绝技的冷血杀手。老虎探长钟朗（吕良伟 饰）和于胜男（李若斯 饰）、康华生（徐亮 饰）及洪小雅（马灿灿 饰）展开联合调查，而初步结果令钟朗心生疑窦。原

圣约翰大学实验室女教授于胜男（李若斯 饰）依据历年判案的经历写出《上海疑案》一书，随即成为热卖作品。在胜男的记者招待会上，一只装有带血匕首的盒子被送入会场，引起骚动，胜男直觉这把刀和她的书有关。与此同时，圣约翰大学一名女学生遇害，胜男和康华生（徐亮 饰）、犯罪学专家洪小雅（马灿灿 饰）一同前往现场调

上海华界和租界一连出了几个命案，经调查死者曾经都是多年前一家名叫“东亚书院”的学校教员。这家学校由日本人开办，其中有部分中国教员，专门收留中国孤儿。凶案中涉及到一个无辜的退休巡捕老薛头……

法租界惊现专杀放荡女人的连环杀手。巡捕房总探长洪涛发现此案与自己十年前未解的一桩悬案有密切联系。洪涛亲自参与调查，逮捕了遵循香味杀人的病态凶手陈有财，同时证实他就是那桩悬案的真凶。

一次蹊跷的银行劫案，老虎探长钟朗和女法医于胜男成为了人质。钟朗与包围银行的探案小组内外配合，与劫匪斗智斗勇， 破获了一起惊天文物大案，保护了价值连城的故宫文物古代石鼓。同时也为护宝献身的文物专家伸了冤。