漫画单行本第5卷同捆OAD

女高中生河本加奈和她的朋友pez、圣、阿满过着平常又有趣的日子，直到骑着机车的宇宙警察晴子闯入她们的生活。与此同时，这个世界正在遭遇外星人的侵略……

这是人类的体内。许许多多的细胞勤奋工作的世界。某日白细胞(中性粒细胞)与红细胞，遇见了收留迷路乳酸菌的一般细胞。为了将乳酸菌护送至同伴身边，白细胞(中性粒细胞)与一般细胞向肠道出发。然而他们却与来者不善的最强敌人重逢。「我和你们到底谁才是正义的一方，趁这次弄个清楚吧」再次现身的癌细胞。以及遭到坏菌破

女高中生河本加奈和她的朋友pez、圣、阿满过着平常又有趣的日子，直到骑着机车的宇宙警察晴子闯入她们的生活。与此同时，这个世界正在遭遇外星人的侵略……

剧场版《FLCL Alternative》由Production I.G与GAINAX共同负责制作的动画剧场版。